Az egyetemen a tudásközpontok, oktatási tevékenységet nem végző szervezetek, amelyek feladata, hogy partnerségben az ipar szereplőivel magas szintű kutatás fejlesztési programokat hajtsanak végre. A Műegyetemen az alábbi központok működnek:
Építőmérnöki Kar:
Gépészmérnöki Kar:
- Biomechanikai Kooperációs Kutatóközpont
- Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem - AUDI Hungaria Kooperációs Kutatóközpont (BME-AUDI K3)
Villamosmérnöki és Informatikai Kar:
-
Egyesült Innovációs és Tudásközpont (EIT)
- Anyagtudományi és Nanotechnológiai Tudásközpont
- Egészségipari Mérnöki Tudásközpont
- Egyetemközi Távközlési és Informatikai Kooperációs Kutatási Központ
- Információtechnológiai Innovációs és Tudásközpont
- Integrált Energetikai Tudásközpont
- Intelligens és Beágyazott Rendszerek Tudásközpont
- Közlekedés, Jármű és Logisztika Tudásközpont
- Morgan Stanley - BME Pénzügyi Innovációs Központ
- Műegyetemi Tudományos Műhelyek és Tehetséggondozás Projektiroda
- Villamoskari Hallgatói Innovációs Központ
- Virtuális Valóság Laboratórium
- EIT Szegedi Kutatócsoport
- EIT Debreceni Kutatócsoport
- Közigazgatási Informatikai Központ (IK)
- Mobil Innovációs Központ
- Smartpolis Tudásközpont
- Műegyetemi Technológia- és Tudástranszfer Iroda
Közlekedésmérnöki és Járműmérnöki Kar:
Gazdaság- és Társadalomtudományi Kar: